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第八识所含藏的种子无量无数。
依三性说：有善种、恶种、无记种，都属有漏。
有漏法种又有三种：１、名言种子、２、我执种子、３、有支种子（业种）。
又种子的异名今略举七种：１、种子、２、习气、３、功能、４、界、５、随眠、６、粗熏、７、亲因缘。
５、阿赖耶识
《成唯识论》云：“或名阿赖耶，摄藏一切杂染品法令不失故。我见爱等执藏，以为自内我故。此名唯在异生有学，非无学位不退菩萨有杂染法执藏义故。”（《大正藏》卷三十一，十三下）
“或名阿赖耶”，译为藏，有能藏、所藏、执藏三种意思。是梵文？laya的音译，意为横躺於底层，是（？－li埋没）这个梵文动词所衍生出来的名词。例如，hima雪，t？laya埋没之处，合成一词为himalaya喜马拉雅，意为大雪山。为雪所埋没之处。
能藏、所藏、执藏，为阿赖耶识自体之相，今略说之。
（１）能藏义：阿赖耶识自身是能藏，前七识心心所法及其他一切法的种子是所藏，是此第八阿赖耶识所执藏故。一切法必有种子为因缘，方能生起，所以此识是宇宙的本体。我们造的业种子和我们的名言习惯心识活动的种子，为此阿赖耶识所摄藏，后遇缘时方能生果，故此识亦为人类生命之本体。在未生果前，这些种子摄藏在阿赖耶识中，不失不坏。我们举心动念都会熏成种子，经云：“若人散乱心，入於塔庙中，一称南无佛，皆共成佛道。”这念佛的一念，就是一个种子，作将来成佛的因。可是这一念种子，经无量劫而不失不坏，就是因为它摄藏在第八识中的缘故。
（２）所藏义：第八识自身是所藏，前七识行转识及其相应诸法，是能藏。因为在现行的果位即现生命上，第八异熟果识被前七转识所熏所缘，故第八识又是所熏、所缘，前面七个心心所法，又是能熏、能缘。我们现在所活动的、所觉察的一切心理现象，就是前七识的活动。第八识被包围在这些活动之中，故为所藏。因为它是无记性，故能受熏成种子。现行果法，就是我们现在的这个生命的总体。这总体的活动在表面上只有前六识最明显，第七识就不易觉察了。但是第七识对第八识是亲切缠缚著，因此我们前七识活动为能熏，就是能藏；阿赖耶识表面上无力活动，是所熏，就是所藏了。依此二义，这第八识——阿赖耶识是遍一切法的，与一切法和合不离的，就是宇宙万有之心体，也可以名为宇宙心。
（３）我爱执藏：这正是说明第七识与第八识的关系。第八识是永远相续不断的，乃至成佛亦不断灭。人生的观念，总以为有个常住不断不坏的生命存在，这个常住的生命总体，就以为是“我”。这就是第八识被第七识执持以为“自我”。所以这第八识体就是“我体”。人生的我执我见，自他分别，物我不平等的观点，就是从此发源的。第八识是所爱执藏著，第七识是能爱执藏者。“我爱”本指第七识相应的我爱自私心理。由此，我爱也就表示了第七识的特性，是爱“我”执“我”的；第八识被此我爱心理所执藏，故云我爱执藏。人类的“私我”观念从此种心理关系上所产生，故阿赖耶识作“我爱执藏”。以上的三藏义，是说明阿赖耶识的自体之相。
这个阿赖耶识的名，可说唯在凡夫“异生”（指一切众生且包含有不同种类各异故）位及二乘“有学”位才有。因此大乘唯识的立场说，凡夫从无始来，有此识之名存在，固不成问题，但就大小乘行者方向，可分开而言。就小乘行者言，从开始修学到有学圣者；就大乘行者言，从开始修行到七地菩萨，不论时间经过多久，於中此识皆名阿赖耶，累它一睦为现行我爱之所缘。可是到了八地以上的不退菩萨，和二乘无学的极果，那时第七识不起我执现行，亦即它不再为现行我爱所缘，不再有“我执”，因而第八识就不得再名为阿赖耶识，所以《成唯识论》说“非无学位，不退菩萨，有杂染法执藏义故”。也就是说，到了无学圣者，八地以上的不退转菩萨，就不再起我爱执藏。
６、异熟识
《成唯识论》云：“或名异熟识，能引生死善不善业异熟果故。此名唯在异生、二乘、诸菩萨位，非如来地犹有异熟无记故。”（《大正藏》卷三十一，十三中）
异熟，梵文vipaka，愿意为“与前因异时的结果已经成熟了”。“以前的因”指的是过去的业（行为），而“已经成熟的果”就是阿赖耶识。所以众生在生死轮转中所感受到的苦乐果报，就是由此识去感受。如作善业，就感受快乐果报，如作恶业，就感受痛苦的果报。虽因中所造的或善或恶有所不同，但到受果报时有“无覆无记”，所谓“因是善恶，果唯无记”。换句话说，现在的自我生命其存在主体的本质如同一张白纸没有善恶，所以任何东西才能摄入其中。
一般的宗教中分为善、恶二种，而佛教却别立了一种从任何一方面也无法判定其善恶，亦即不属善也不属恶的价值观；例如肚饥而食，无属善恶是无记性，此为佛教价值观的一大特色。
异熟识是阿赖耶识的果相，因为异熟是从果上立名的，要具备三个条件才能叫异熟果识。（１）业果义：其自身一定是善恶业所感召的果报；（２）不间断义：谓一期果报不断，就是一个生命，从生至死，虽是有期限的，但从入母胎起至死亡为止，名日一期果报。虽可明见，但这只是这个身体的生与灭，其实，生命体是无限的，不间断的，不因身体的死亡而间断。（３）遍三界义：此异熟果必遍三界九地，如今生在欲界，来生或可到色界、无色界。前五识则不能遍三界，如鼻识与舌识色界就没有了，无色界中五识皆无。故《成唯识论》云：“此是能引诸界趣生、善不善业，异熟果故。离此，命根众同分等，恒时相续，胜异熟果不可得故……此识果相虽多位多种，异熟实不共故偏说”（《大正藏》卷三十一，七下）
此异熟识，不论是凡是圣，其所有果报，皆由善恶业的感，没有哪个可超出此范围。可是到了佛果，此识成纯善无漏，不再成为有漏业所支配招感的无记异熟果。因此论云：“非如来地犹有异熟无记法故。”
７、无垢识
《成唯识论》云：“或名无垢识，最极清净诸无漏法所依止故，此名唯在如来地有；菩萨，二乘及异生位，持有漏种可受熏习，未得善净第八识故。”
无垢识，或称为阿摩罗识或庵摩罗识，是无漏净分的第八识，真谛三藏另立第九识为无垢识。此识与大圆镜智相应，由於是最清净的，所以是诸无漏法之所依止。所依止的识是无垢清净的，能依止的诸法当亦是清净无垢，所以叫做无垢识。
此无垢识依《成唯识论》上所言只有在最高的如来地才有，菩萨、二乘及凡夫众生由於仍然执持有漏种子，而且还受前七识现行的“薰习”，所以尚未得无垢的“善净第八识”。第八识有净分亦有染分（杂染有漏），吾人之所以会为无明烦恼所系缚，皆因此第八识常被第七识执之为我，且爱之不舍。如同守护财宝者，严守不失。
第八识有三相，自相、果相、因相。今将三相、三位、三名之关系死表如下：（略）
阿赖耶识，依心理学说，是一种潜藏意识，或曰无意识。前者说明其功能作用潜伏而不显现，后者是说无第六意识之活动作用。虽如此，但此识在唯识学上名为“不可知”，说明其作用微细而不可知，但是它亦有它的功用，含藏善、恶、无记种子，执持色身（由於有第八识的存在我们才得以保持色身不坏、会思考活动）；去缘宇宙界的一切现界。
此第八识是我们的生命根源，这生命体从无始以来乃至成佛皆不坏，只是转变性质而已。如《解深密经》卷一云：
“於六趣生死，彼彼有情，随彼彼有情众生，或在卵生，或在胎生，或在湿生，或在化生，身分生起，於中最初一切种子心识成熟，展转和合，增长广大……。”（《大正藏》卷十六，六九二中）
经文中的“一切种子”即是阿赖耶识的因相，由於此义，阿赖耶即是人的生命本源，经论上言，“根本识”、“究生死蕴”、“有分心”、“爱阿赖耶”等都是就生命体上说的，是属精神方面。又《摄大乘论》卷上云：
“復何缘故，此识说明阿赖耶？一切有生杂染品法，於此摄藏为果性故。又即此识於彼摄藏为因性故，是故说名为阿赖耶识，或诸有情摄藏此识为自我故。”（《大正藏》卷三十一，一三三中）
又在《摄大乘论》中立“所知依”，不是在说明宇宙万有诸法，若染、若净、若精神、若物质、若无形、若有形都是要依托此阿赖耶识方能生起。由此我们可说阿赖耶识是人生与宇宙的总合体，精神和物质的总聚体。
四·善与恶的本源
阿赖耶识是存在和认识的根源本体，同时也是形成善或恶的根本。
佛教所谓的恶，一言以蔽之，即以贪（贪婪）、瞋（愤怒）、痴（无智）为代表的“烦恼”（Kle？a）（音译：吉隶舍）。这些罪恶的一切心理状态，都从阿赖耶识之中的烦恼种子所生，这些恶产生完毕之后，新的邪恶种子同时又种植於阿赖耶识之中。换言之，阿赖耶识就像取之不尽，不断喷出罪恶热汤的水壶。虽然如此，但是阿赖耶识同时也是使我们从罪恶迈向良善的桥梁。吾人通过阿赖耶识，驼为媒介体，可以达到舍恶趋善之境。阿赖耶识之中虽藏有恶的种子，但